De fossielen encyclopedie toont een doorsnede van het planten- en dierenrijk, zoals deze zich ontwikkeld hebben vanaf Proterozoicum tot het heden. De planten zijn van de eencelligen tot de bedektzadigen ingedeeld in het eerste hoofdstuk volgens het paleobotanische systeem, de dieren van de eencelligen tot de chordadieren in het 2e tot het 7e hoofdstuk volgens het paleozoölogische systeem. Bij alle systematische categorieën worden vanaf de stammen (afdelingen) tot de families de periodes vermeld, waarin ze voorkomen; de dateringen worden gepreciseerd door een stratigrafische tabel aan het einde van het boek.